Bioinformatique: Quelle est la différence entre l'alignement d'une lecture fastq sur STAR et l'alignement de deux lectures fastq sur STAR? http://www.genefriends.org/RNAseqForDummies/


Réponse 1:

Qu'entendez-vous par un fastq ou deux fastq? faites-vous référence à des lectures à une seule extrémité ou à des lectures à deux extrémités? Vous pouvez toujours connaître la différence entre l'efficacité d'une seule extrémité et l'efficacité de la séquence d'extrémité appariée. Cela est dû à la capture et à la couverture et se résume à une connaissance beaucoup plus précise des transcriptions avec moins d'artefacts et de faux positifs.